In Niederbayern konzentriert sich das Wellnessangebot mit Poolanlagen vor allem auf das Bayerische Bäderdreieck und Orte wie Bad Gögging oder Rattenberg. Die 10 gelisteten Häuser nutzen häufig die lokalen Thermalquellen, wobei die Spa-Flächen im Durchschnitt 3217 m² erreichen. Im Hotel Holzapfel in Bad Füssing steht Gästen beispielsweise eine Wellnesslandschaft von 5000 m² zur Verfügung, die neben klassischen Becken auch einen Infinity-Pool umfasst. Diese Kombination aus mineralisiertem Thermalwasser und moderner Architektur prägt die Badelandschaften in Bad Griesbach und Bad Füssing maßgeblich und unterscheidet sie von rein sportorientierten Schwimmbecken.
Das Dorint MARC AUREL Resort Bad Gögging bietet auf 2800 m² Wasserflächen, die sich an der römischen Historie des Ortes orientieren. Während das Posthotel in Rattenberg im mittelpreisigen Segment liegt, finden sich im Ortner's Resort in Bad Füssing luxuriöse Pool-Installationen mit Infinity-Kante. Die Wassertemperaturen in Häusern wie dem Bio-Thermalhotel Falkenhof werden durch die natürlichen Thermalvorkommen gespeist, was den Aufenthalt in der Region zwischen Donau und Bayerischem Wald charakterisiert. Im Johannesbad Hotel Palace in Bad Füssing stehen 3000 m² Spa-Fläche bereit, während das Hotel Drei Quellen Therme in Bad Griesbach mit 1500 m² eine spezialisierte Umgebung für Badegäste schafft.